Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc8D3YZV8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms