Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm4950D3YUM8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm4950D3YUM8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms