Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3259D3YUK0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3259D3YUK0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms