Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d4D3YUH6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms