Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cttnbp2B9EJA2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms