Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzd8B9EJ80 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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