Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Phf11cB4XVP9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Phf11cB4XVP9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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