Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm6133B2RY53 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms