Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnldc1B2RXZ1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms