Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia1B2RXQ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ppfia1B2RXQ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms