Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cspp1B2RX88 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms