Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cfap58B2RW38 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms