Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Abcc8B2RUS7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Abcc8B2RUS7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms