Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrn3B2RS91 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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