Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf518bB2RRE4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf518bB2RRE4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms