Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brpf1B2RRD7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Brpf1B2RRD7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms