Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nipsnap3aB1AWZ3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms