Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spocd1B1ASB6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Spocd1B1ASB6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms