Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Grik3B1AS29 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms