Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Skint6A7XUZ6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms