Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms