Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CatsperbA2RTF1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CatsperbA2RTF1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms