Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Btbd35f28A2CFD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Btbd35f28A2CFD5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms