Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ism1A2ATD1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms