Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga8A2ARA8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms