Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SktA2AQ25 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SktA2AQ25 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms