Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttll9A2APC3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttll9A2APC3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms