Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Frmpd1A2AKB4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Frmpd1A2AKB4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms