Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lcn6A2AJB9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lcn6A2AJB9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lcn6A2AJB9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lcn6A2AJB9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lcn6A2AJB9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lcn6A2AJB9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lcn6A2AJB9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lcn6A2AJB9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms