Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ambra1A2AH22 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms