Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbbp8nlA2ABX0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp8nlA2ABX0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms