Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Prdm16A2A935 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm16A2A935 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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