Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Pramef6A2A8M8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms