Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtprfA2A8L5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms