Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nlrp1bA1Z198 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nlrp1bA1Z198 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms