Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc194A0A140LIT1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc194A0A140LIT1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc194A0A140LIT1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ccdc194A0A140LIT1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc194A0A140LIT1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ccdc194A0A140LIT1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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