Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms