Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Trbv30A0A0B4J1P1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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