Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

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Length 1,202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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BC034090A0A087WP46 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BC034090A0A087WP46 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC034090A0A087WP46 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC034090A0A087WP46 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC034090A0A087WP46 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BC034090A0A087WP46 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BC034090A0A087WP46 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BC034090A0A087WP46 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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BC034090A0A087WP46 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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BC034090A0A087WP46 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC034090A0A087WP46 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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BC034090A0A087WP46 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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BC034090A0A087WP46 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BC034090A0A087WP46 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
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BC034090A0A087WP46 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BC034090A0A087WP46 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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BC034090A0A087WP46 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BC034090A0A087WP46 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC034090A0A087WP46 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC034090A0A087WP46 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BC034090A0A087WP46 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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