Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trbv31A0A075B5J5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Trbv31A0A075B5J5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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