Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn2r25W4VSP2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms