Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm26992S4R1A3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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