Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Top3bQ9Z321 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Top3bQ9Z321 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms