Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt27Q9Z320 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Krt27Q9Z320 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms