Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gria3Q9Z2W9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms