Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac5Q9Z2V6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac5Q9Z2V6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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