Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Knop1Q9Z2Q2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Knop1Q9Z2Q2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms