Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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