Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccne2Q9Z238 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccne2Q9Z238 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms