Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lgr5Q9Z1P4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms